| TF1 | TF2 | GoogleScholar | PubMed | HPREF | Rual et al | MPPI | |
| PAX5 | SP1 | Y (106) | Y (1) | N | N | N | |
| PAX5 | YY1 | Y (37) | Y (2) | N | N | N | |
| PAX5 | ELK1 | Y (14) | N (0) | N | N | N | |
| PAX5 | EP300 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| PAX5 | ZNF42 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| PAX5 | PAX4 | Y (63) | Y (1) | N | N | N | |
| PAX5 | KLF4 | N (2) | N (0) | N | N | N | |
| CEBPA | TFAP2C | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| CEBPA | CUTL1 | Y (4) | Y (1) | N | N | N | |
| CEBPA | PBX1 | Y (10) | N (0) | N | N | N | |
| CEBPA | SP1 | Y (31) | N (0) | N | N | N | |
| CEBPA | REPIN1 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| CEBPA | FOXI1 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| CEBPA | TCF8 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| CEBPA | RUNX1 | Y (46) | Y (3) | N | N | N | |
| CEBPA | SRY | Y (8) | N (0) | N | N | N | |
| CEBPA | RREB1 | Y (3) | N (0) | N | N | N | |
| CEBPA | EP300 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| CEBPA | ZNF42 | N (1) | N (0) | N | N | N | |
| CEBPA | GATA1 | Y (31) | Y (1) | N | N | N | |
| CEBPA | ZNFN1A1 | N (2) | N (0) | N | N | N | |
| CEBPA | EN1 | N (1) | N (0) | N | N | N | |
| CEBPA | PAX4 | N (2) | N (0) | N | N | N | |
| FOXJ2 | TCF1 | N (2) | N (0) | N | N | N | |
| FOXJ2 | PAX6 | Y (5) | N (0) | N | N | N | |
| FOXJ2 | PBX1 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| FOXJ2 | NFATC2 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| FOXJ2 | SOX9 | N (2) | N (0) | N | N | N | |
| FOXJ2 | HSF1 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| FOXJ2 | FOXC1 | Y (7) | Y (1) | N | N | N | |
| FOXJ2 | FOXI1 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| FOXJ2 | POU2F1 | Y (3) | Y (1) | N | N | N | |
| FOXJ2 | IRF1 | N (1) | N (0) | N | N | N | |
| FOXJ2 | TCF8 | N (1) | N (0) | N | N | N | |
| FOXJ2 | HNF4A | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| FOXJ2 | FOXD3 | Y (8) | Y (1) | N | N | N | |
| FOXJ2 | NRC1 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| FOXJ2 | NF1 | N (1) | N (0) | N | N | N | |
| FOXJ2 | NKX6NAN | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| FOXJ2 | SRY | Y (5) | N (0) | N | N | N | |
| FOXJ2 | ELK1 | Y (4) | N (0) | N | N | N | |
| FOXJ2 | SOX5 | N (1) | N (0) | N | N | N | |
| FOXJ2 | ILK | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| FOXJ2 | PAX4 | N (1) | N (0) | N | N | N | |
| FOXJ2 | KLF4 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| CEBPB | CEBPB | NAN | NAN | NAN | NAN | NAN | |
| CEBPB | PBX1 | Y (9) | N (0) | N | N | N | |
| CEBPB | CEBPA | Y (43) | Y (3) | Y | N | N | |
| CEBPB | SP1 | Y (36) | Y (1) | Y | N | N | |
| CEBPB | SRY | Y (13) | N (0) | N | N | N | |
| CEBPB | ZNF42 | Y (3) | N (0) | N | N | N | |
| CEBPB | PAX4 | N (2) | N (0) | N | N | N | |
| CEBPB | KLF4 | Y (6) | N (0) | N | N | N | |
| CEBPB | TFAP2C | N (2) | N (0) | N | N | N | |
| CEBPB | NFATC2 | Y (11) | N (0) | Y | N | N | |
| CEBPB | GATA2 | Y (8) | N (0) | N | N | N | |
| CEBPB | TCF8 | Y (5) | N (0) | N | N | N | |
| CEBPB | HNF4A | N (2) | N (0) | Y | N | N | |
| CEBPB | GATA3 | Y (28) | N (0) | N | N | N | |
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| CEBPB | EP300 | Y (6) | N (0) | Y | N | N | |
| CEBPB | GATA1 | Y (11) | N (0) | N | N | N | |
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| TAL1 | ZNF42 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| TAL1 | PAX4 | Y (5) | N (0) | N | N | N | |
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| TFAP2C | KLF4 | Y (3) | N (0) | N | N | N | |
| CUTL1 | TBP | Y (7) | N (0) | N | N | N | |
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| CUTL1 | CUTL1 | NAN | NAN | NAN | NAN | NAN | |
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| TCF1 | TCF8 | Y (4) | N (0) | N | N | N | |
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| E2F2 | ZNF42 | N (0) | N (0) | N | Y | N | |
| E2F2 | PAX4 | Y (3) | N (0) | N | Y | N | |
| E2F2 | KLF4 | N (0) | N (0) | N | Y | N | |
| SREBF1 | SP1 | Y (13) | N (0) | Y | N | N | |
| SREBF1 | ZNF42 | Y (3) | N (0) | N | N | N | |
| SREBF1 | PAX4 | N (1) | N (0) | N | N | N | |
| NFYC | NFYB | Y (11) | Y (2) | Y | N | N | |
| NFYC | SP1 | Y (7) | N (0) | Y | N | N | |
| NFYC | TCF1 | N (1) | N (0) | N | N | N | |
| NFYC | GATA3 | N (1) | N (0) | N | N | N | |
| NFYC | NFE2L1 | N (2) | N (0) | N | N | N | |
| NFYC | RUNX1 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| NFYC | RREB1 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| NFYC | ELK1 | N (1) | N (0) | N | N | N | |
| NFYC | EP300 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| NFYC | ZNF42 | N (1) | N (0) | N | N | N | |
| NFYC | GATA1 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| NFYC | ILK | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| NFYC | ZNFN1A1 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| NFYC | EN1 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| NFYC | PAX4 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| NFYC | KLF4 | N (1) | N (0) | N | N | N | |
| LMO2 | RFX1 | Y (5) | N (0) | N | Y | N | |
| LMO2 | YY1 | Y (20) | N (0) | N | Y | N | |
| LMO2 | NFATC2 | N (0) | N (0) | N | Y | N | |
| LMO2 | CEBPA | Y (7) | Y (1) | N | Y | N | |
| LMO2 | SP1 | Y (117) | Y (2) | Y | Y | N | |
| LMO2 | HSF1 | Y (5) | N (0) | N | Y | N | |
| LMO2 | POU2F1 | N (2) | Y (1) | N | Y | N | |
| LMO2 | GATA2 | Y (52) | Y (5) | N | Y | N | |
| LMO2 | TCF1 | Y (9) | N (0) | N | Y | N | |
| LMO2 | TCF8 | N (0) | N (0) | N | Y | N | |
| LMO2 | HNF4A | N (1) | N (0) | N | Y | N | |
| LMO2 | GATA3 | Y (64) | Y (2) | N | Y | N | |
| LMO2 | NRC1 | N (0) | N (0) | N | Y | N | |
| LMO2 | SRY | Y (14) | N (0) | N | Y | N | |
| LMO2 | RREB1 | Y (3) | N (0) | N | Y | N | |
| LMO2 | ELK1 | N (1) | N (0) | N | Y | N | |
| LMO2 | EP300 | N (2) | N (0) | Y | Y | N | |
| LMO2 | ZNF42 | N (1) | N (0) | N | Y | N | |
| LMO2 | GATA1 | Y (135) | Y (5) | N | Y | N | |
| LMO2 | ILK | Y (9) | N (0) | N | Y | N | |
| LMO2 | ZNFN1A1 | N (1) | N (0) | N | Y | N | |
| LMO2 | HOXA3 | Y (6) | N (0) | N | Y | N | |
| LMO2 | PAX4 | Y (3) | N (0) | N | Y | N | |
| LMO2 | KLF4 | Y (8) | N (0) | N | Y | N | |
| MEIS1 | TGIF | Y (58) | Y (6) | N | N | N | |
| RFX1 | RFX1 | NAN | NAN | NAN | NAN | NAN | |
| RFX1 | NFATC2 | N (2) | N (0) | N | N | N | |
| RFX1 | REL | Y (24) | N (0) | N | N | N | |
| RFX1 | FOXI1 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| RFX1 | TCF8 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| RFX1 | HNF4A | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| RFX1 | NRC1 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| RFX1 | SRY | Y (7) | N (0) | N | N | N | |
| RFX1 | RREB1 | Y (3) | N (0) | N | N | N | |
| RFX1 | ELK1 | Y (10) | Y (1) | N | N | N | |
| RFX1 | ZNF42 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| RFX1 | ILK | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| RFX1 | PAX4 | Y (6) | Y (1) | N | N | N | |
| RFX1 | KLF4 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| PAX6 | PBX1 | Y (98) | Y (2) | N | Y | N | |
| PAX6 | NFATC2 | N (2) | N (0) | N | Y | N | |
| PAX6 | FOXI1 | N (0) | N (0) | N | Y | N | |
| PAX6 | POU2F1 | N (1) | N (0) | N | Y | N | |
| PAX6 | SRY | Y (138) | N (0) | N | Y | N | |
| PAX6 | ZNF42 | N (2) | N (0) | N | Y | N | |
| PAX6 | EN1 | Y (226) | Y (12) | N | Y | N | |
| PAX6 | PAX4 | Y (281) | Y (29) | N | Y | N | |
| PAX6 | KLF4 | Y (8) | N (0) | N | Y | N | |
| TBP | CUTL1 | Y (7) | N (0) | N | N | N | |
| TBP | SRY | Y (180) | Y (3) | N | N | N | |
| TBP | NKX2-5 | N (1) | N (0) | N | N | N | |
| RELA | REL | N ("69,200") | Y (450) | Y | Y | N | |
| RELA | ZNF42 | Y (3) | N (0) | N | Y | N | |
| RELA | KLF4 | Y (20) | Y (2) | N | Y | N | |
| NF1 | SP1 | Y (912) | Y (95) | N | N | N | |
| NF1 | REPIN1 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| NF1 | HNF4A | Y (6) | N (0) | N | N | N | |
| NF1 | RREB1 | Y (3) | N (0) | N | N | N | |
| NF1 | ZNF42 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| NF1 | HOXA3 | Y (10) | N (0) | N | N | N | |
| NF1 | PAX4 | Y (5) | N (0) | N | N | N | |
| NF1 | KLF4 | N (1) | N (0) | N | N | N | |
| EGR1 | SP1 | Y (459) | Y (92) | N | N | N | |
| EGR1 | RREB1 | Y (6) | N (0) | N | N | N | |
| EGR1 | EP300 | Y (8) | N (0) | N | N | N | |
| EGR1 | ZNF42 | Y (3) | N (0) | N | N | N | |
| EGR1 | PAX4 | Y (7) | N (0) | N | N | N | |
| EGR1 | KLF4 | Y (20) | N (0) | N | N | N | |
| USF1 | HNF4A | Y (3) | N (0) | N | N | N | |
| USF1 | SP1 | Y (286) | Y (19) | N | N | N | |
| USF1 | HOXA9 | Y (8) | N (0) | N | N | N | |
| USF1 | NFE2L1 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| USF1 | MYC | Y (292) | Y (18) | N | N | N | |
| USF1 | ACTR1A | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| USF1 | RREB1 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| USF1 | EP300 | N (1) | N (0) | N | N | N | |
| USF1 | ZNF42 | N (2) | N (0) | N | N | N | |
| USF1 | PAX4 | N (2) | N (0) | N | N | N | |
| ZNF482 | SP1 | N (1) | Y (1) | N | N | N | |
| ZNF482 | EP300 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| ZNF482 | ZNF42 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| ZNF482 | GATA1 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| ZNF482 | ILK | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| ZNF482 | ZNFN1A1 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| ZNF482 | PAX4 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| ZNF482 | KLF4 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| PBX1 | NFATC2 | N (2) | N (0) | N | N | N | |
| PBX1 | SOX9 | Y (17) | N (0) | N | N | N | |
| PBX1 | HSF1 | Y (8) | N (0) | N | N | N | |
| PBX1 | FOXI1 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| PBX1 | POU2F1 | Y (5) | N (0) | N | N | N | |
| PBX1 | IRF1 | Y (18) | N (0) | N | N | N | |
| PBX1 | TCF8 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| PBX1 | HNF4A | Y (4) | N (0) | N | N | N | |
| PBX1 | FOXD3 | Y (8) | N (0) | N | N | N | |
| PBX1 | NRC1 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| PBX1 | CEBPA | Y (10) | N (0) | N | N | N | |
| PBX1 | SP1 | Y (112) | Y (1) | N | N | N | |
| PBX1 | NF1 | Y (46) | N (0) | N | N | N | |
| PBX1 | YAP1 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| PBX1 | NKX6NAN | Y (3) | N (0) | N | N | N | |
| PBX1 | SRY | Y (38) | N (0) | N | N | N | |
| PBX1 | ELK1 | Y (10) | N (0) | N | N | N | |
| PBX1 | ZNF42 | N (2) | N (0) | N | N | N | |
| PBX1 | TFCP2 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| PBX1 | SOX5 | Y (7) | N (0) | N | N | N | |
| PBX1 | HOXA3 | Y (28) | Y (1) | N | N | N | |
| PBX1 | NKX2-5 | Y (5) | Y (1) | N | N | N | |
| PBX1 | EN1 | Y (25) | N (0) | N | N | N | |
| PBX1 | PAX4 | Y (32) | N (0) | N | N | N | |
| PBX1 | KLF4 | Y (4) | N (0) | N | N | N | |
| YY1 | SP1 | N ("1,330") | Y (74) | Y | Y | N | |
| YY1 | EP300 | Y (11) | N (0) | Y | Y | N | |
| YY1 | ZNF42 | Y (3) | N (0) | N | Y | N | |
| YY1 | ILK | Y (12) | N (0) | N | Y | N | |
| YY1 | PAX4 | Y (14) | N (0) | N | Y | N | |
| YY1 | KLF4 | Y (11) | N (0) | N | Y | N | |
| YY1 | NFATC2 | Y (17) | N (0) | N | Y | N | |
| YY1 | TCF8 | Y (4) | N (0) | N | Y | N | |
| YY1 | HNF4A | N (2) | N (0) | N | Y | N | |
| YY1 | GATA3 | Y (51) | N (0) | N | Y | N | |
| YY1 | RREB1 | Y (5) | N (0) | N | Y | N | |
| YY1 | ELK1 | Y (28) | Y (1) | N | Y | N | |
| YY1 | GATA1 | Y (94) | Y (3) | N | Y | N | |
| YY1 | ZNFN1A1 | N (2) | N (0) | N | Y | N | |
| HNF4A | NFATC2 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| HNF4A | REPIN1 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| HNF4A | TCF8 | N (1) | N (0) | N | N | N | |
| HNF4A | HNF4A | NAN | NAN | NAN | NAN | NAN | |
| HNF4A | NFE2L1 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| HNF4A | SRY | Y (3) | N (0) | N | N | N | |
| HNF4A | ELK1 | Y (3) | Y (1) | N | N | N | |
| HNF4A | ZNF42 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| HNF4A | MSX1 | N (2) | N (0) | N | N | N | |
| HNF4A | KLF4 | N (1) | N (0) | N | N | N | |
| NFATC2 | SOX9 | Y (5) | N (0) | N | N | N | |
| NFATC2 | CEBPA | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| NFATC2 | TP53 | N (2) | N (0) | Y | N | N | |
| NFATC2 | REL | Y (125) | Y (1) | N | N | N | |
| NFATC2 | SP1 | Y (47) | Y (2) | N | N | N | |
| NFATC2 | HSF1 | Y (3) | N (0) | N | N | N | |
| NFATC2 | FOXI1 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| NFATC2 | POU2F1 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| NFATC2 | IRF1 | Y (18) | N (0) | N | N | N | |
| NFATC2 | GATA2 | Y (12) | N (0) | Y | N | N | |
| NFATC2 | TCF8 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| NFATC2 | HNF4A | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| NFATC2 | FOXD3 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| NFATC2 | GATA3 | Y (56) | Y (1) | N | N | N | |
| NFATC2 | NRC1 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| NFATC2 | NF1 | Y (3) | N (0) | N | N | N | |
| NFATC2 | ACTR1A | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| NFATC2 | NKX6NAN | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| NFATC2 | SRY | N (2) | N (0) | N | N | N | |
| NFATC2 | RREB1 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| NFATC2 | ELK1 | Y (7) | N (0) | N | N | N | |
| NFATC2 | EP300 | Y (3) | N (0) | N | N | N | |
| NFATC2 | ZNF42 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| NFATC2 | GATA1 | N (2) | N (0) | N | N | N | |
| NFATC2 | ILK | N (1) | N (0) | N | N | N | |
| NFATC2 | ZNFN1A1 | N (2) | N (0) | N | N | N | |
| NFATC2 | HOXA3 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| NFATC2 | HOXA5 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| NFATC2 | NKX2-5 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| NFATC2 | PAX4 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| NFATC2 | KLF4 | N (1) | N (0) | N | N | N | |
| MYB | SP1 | N ("1,400") | Y (51) | N | N | N | |
| MYB | HOXA9 | Y (122) | Y (2) | N | N | N | |
| MYB | RREB1 | Y (7) | N (0) | N | N | N | |
| MYB | TFCP2 | N (2) | N (0) | N | N | N | |
| MYB | PAX4 | Y (12) | N (0) | N | N | N | |
| none | SRY | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| SOX9 | FOXI1 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| SOX9 | TCF8 | N (2) | Y (1) | N | N | N | |
| SOX9 | HNF4A | N (1) | N (0) | N | N | N | |
| SOX9 | FOXD3 | Y (32) | Y (5) | N | N | N | |
| SOX9 | NKX6NAN | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| SOX9 | SRY | N ("1,170") | Y (164) | N | N | N | |
| SOX9 | ELK1 | Y (4) | Y (1) | N | N | N | |
| SOX9 | SOX5 | Y (266) | Y (24) | N | N | N | |
| SOX9 | PAX4 | Y (7) | Y (1) | N | N | N | |
| SOX9 | KLF4 | Y (4) | N (0) | N | N | N | |
| CEBPA | HNF4A | Y (4) | N (0) | N | N | N | |
| CEBPA | GATA3 | Y (6) | Y (1) | N | N | N | |
| CEBPA | ELK1 | Y (6) | N (0) | N | N | N | |
| CEBPA | ILK | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| CEBPA | NKX2-5 | N (1) | N (0) | N | N | N | |
| CEBPA | KLF4 | N (2) | N (0) | N | N | N | |
| TP53 | SP1 | Y (179) | Y (98) | Y | Y | N | |
| TP53 | TCF8 | N (2) | Y (1) | N | Y | N | |
| TP53 | HNF4A | Y (6) | N (0) | Y | Y | N | |
| TP53 | NFE2L1 | N (1) | N (0) | N | Y | N | |
| TP53 | RREB1 | N (1) | N (0) | N | Y | N | |
| TP53 | ELK1 | Y (22) | Y (2) | N | Y | N | |
| TP53 | EP300 | Y (32) | Y (2) | Y | Y | Y | |
| TP53 | ZNF42 | N (2) | N (0) | N | Y | N | |
| TP53 | GATA1 | Y (14) | N (0) | N | Y | N | |
| TP53 | ILK | Y (24) | N (0) | N | Y | N | |
| TP53 | ZNFN1A1 | Y (7) | N (0) | N | Y | N | |
| TP53 | PAX4 | N (2) | N (0) | N | Y | N | |
| TP53 | KLF4 | Y (9) | Y (4) | N | Y | N | |
| REL | SP1 | N ("2,520") | Y (35) | Y | N | N | |
| REL | POU2F1 | N (1) | N (0) | Y | N | N | |
| REL | TCF8 | Y (5) | N (0) | N | N | N | |
| REL | HNF4A | Y (10) | N (0) | N | N | N | |
| REL | NF1 | Y (351) | Y (1) | N | N | N | |
| REL | SRY | Y (310) | N (0) | N | N | N | |
| REL | RREB1 | Y (6) | N (0) | N | N | N | |
| REL | ELK1 | Y (148) | N (0) | N | N | N | |
| REL | ZNF42 | Y (5) | N (0) | N | N | N | |
| REL | TFCP2 | Y (3) | N (0) | N | N | N | |
| REL | ILK | N ("1,580") | N (0) | N | N | N | |
| REL | HOXA3 | Y (11) | N (0) | N | N | N | |
| REL | PAX4 | Y (22) | N (0) | N | N | N | |
| REL | KLF4 | Y (17) | Y (1) | N | N | N | |
| SP1 | HOXA9 | Y (45) | N (0) | N | N | N | |
| SP1 | HSF1 | Y (141) | Y (6) | N | N | N | |
| SP1 | REPIN1 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| SP1 | POU2F1 | Y (14) | N (0) | Y | N | N | |
| SP1 | GATA2 | Y (81) | Y (11) | Y | N | N | |
| SP1 | CUTL1 | Y (20) | N (0) | Y | N | N | |
| SP1 | TCF8 | Y (6) | N (0) | N | N | N | |
| SP1 | PAX2 | Y (91) | N (0) | N | N | N | |
| SP1 | HNF4A | Y (23) | N (0) | Y | N | N | |
| SP1 | GATA3 | Y (161) | Y (5) | N | N | N | |
| SP1 | NRC1 | N (1) | N (0) | N | N | N | |
| SP1 | CEBPA | Y (31) | N (0) | N | N | N | |
| SP1 | SP1 | NAN | NAN | NAN | NAN | NAN | |
| SP1 | CREB1 | Y (72) | Y (7) | N | N | N | |
| SP1 | XBP1 | Y (22) | N (0) | N | N | N | |
| SP1 | RUNX1 | Y (79) | Y (5) | N | N | N | |
| SP1 | ACTR1A | N (1) | N (0) | N | N | N | |
| SP1 | ESR1 | Y (60) | Y (1) | Y | N | N | |
| SP1 | HAND1 | Y (22) | Y (1) | N | N | N | |
| SP1 | RREB1 | Y (12) | N (0) | N | N | N | |
| SP1 | ELK1 | Y (198) | Y (1) | Y | N | N | |
| SP1 | EP300 | Y (26) | N (0) | Y | N | N | |
| SP1 | ARNT | Y (360) | Y (13) | N | N | Y | |
| SP1 | ZNF42 | Y (6) | Y (3) | N | N | N | |
| SP1 | MYB | N ("1,400") | Y (51) | N | N | N | |
| SP1 | TFCP2 | Y (4) | N (0) | N | N | N | |
| SP1 | GATA1 | Y (283) | Y (10) | N | N | N | |
| SP1 | ILK | Y (83) | N (0) | N | N | N | |
| SP1 | ZNFN1A1 | Y (3) | N (0) | N | N | N | |
| SP1 | HOXA3 | Y (15) | N (0) | N | N | N | |
| SP1 | HOXA5 | Y (37) | N (0) | N | N | N | |
| SP1 | NKX2-5 | Y (6) | Y (7) | N | N | N | |
| SP1 | EN1 | Y (48) | N (0) | N | N | N | |
| SP1 | PAX4 | Y (38) | N (0) | N | N | N | |
| SP1 | KLF4 | Y (108) | Y (10) | N | N | N | |
| SP1 | none | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| HOXA9 | REPIN1 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| HOXA9 | TCF1 | Y (6) | N (0) | N | N | N | |
| HOXA9 | GATA3 | Y (16) | N (0) | N | N | N | |
| HOXA9 | NFE2L1 | N (1) | N (0) | N | N | N | |
| HOXA9 | SP1 | Y (45) | N (0) | N | N | N | |
| HOXA9 | RUNX1 | Y (49) | N (0) | N | N | N | |
| HOXA9 | NF1 | Y (35) | N (0) | N | N | N | |
| HOXA9 | YAP1 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| HOXA9 | SRY | Y (20) | N (0) | N | N | N | |
| HOXA9 | ELK1 | Y (3) | N (0) | N | N | N | |
| HOXA9 | ZNF42 | N (1) | N (0) | N | N | N | |
| HOXA9 | GATA1 | Y (26) | N (0) | N | N | N | |
| HOXA9 | SOX5 | Y (3) | N (0) | N | N | N | |
| HOXA9 | ZNFN1A1 | Y (3) | N (0) | N | N | N | |
| HOXA9 | MSX1 | Y (27) | N (0) | N | N | N | |
| HOXA9 | NKX2-5 | N (1) | N (0) | N | N | N | |
| HOXA9 | PAX4 | N (2) | Y (1) | N | N | N | |
| HOXA9 | KLF4 | Y (5) | N (0) | N | N | N | |
| HSF1 | FOXI1 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| HSF1 | IRF1 | Y (12) | N (0) | N | N | N | |
| HSF1 | HNF4A | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| HSF1 | NRC1 | N (0) | N (0) | Y | N | N | |
| HSF1 | SP1 | Y (141) | Y (6) | N | N | N | |
| HSF1 | SRY | Y (13) | N (0) | N | N | N | |
| HSF1 | ELK1 | Y (10) | N (0) | N | N | N | |
| HSF1 | EP300 | N (1) | N (0) | N | N | N | |
| HSF1 | ZNF42 | N (1) | N (0) | N | N | N | |
| HSF1 | TFCP2 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| HSF1 | HOXA3 | N (2) | N (0) | N | N | N | |
| HSF1 | PAX4 | Y (4) | N (0) | N | N | N | |
| HSF1 | KLF4 | N (1) | N (0) | N | N | N | |
| REPIN1 | NFE2L1 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| REPIN1 | SP1 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| REPIN1 | ACTR1A | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| REPIN1 | RREB1 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| REPIN1 | ZNF42 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| REPIN1 | PAX4 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| JUN | CUTL1 | Y (21) | N (0) | N | N | N | |
| JUN | SRY | Y (550) | Y (1) | Y | N | N | |
| JUN | MSX1 | Y (161) | Y (2) | N | N | N | |
| JUN | PAX4 | Y (80) | N (0) | N | N | N | |
| JUN | KLF4 | Y (77) | N (0) | N | N | N | |
| CUTL1 | PAX4 | Y (3) | N (0) | N | N | N | |
| FOXC1 | FOXI1 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| FOXC1 | FOXD3 | Y (16) | Y (1) | N | N | N | |
| FOXC1 | SRY | Y (16) | N (0) | N | N | N | |
| FOXC1 | PAX4 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| FOXC1 | KLF4 | N (1) | N (0) | N | N | N | |
| FOXI1 | POU2F1 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| FOXI1 | IRF1 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| FOXI1 | TCF8 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| FOXI1 | HNF4A | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| FOXI1 | FOXD3 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| FOXI1 | NRC1 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| FOXI1 | RUNX1 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| FOXI1 | NKX6NAN | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| FOXI1 | SRY | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| FOXI1 | RREB1 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| FOXI1 | ELK1 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| FOXI1 | MYB | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| FOXI1 | TFCP2 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| FOXI1 | SOX5 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| FOXI1 | ILK | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| FOXI1 | HOXA3 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| FOXI1 | EN1 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| FOXI1 | PAX4 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| FOXI1 | KLF4 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| POU2F1 | IRF1 | N (0) | N (0) | N | Y | N | |
| POU2F1 | TCF8 | N (0) | N (0) | N | Y | N | |
| POU2F1 | HNF4A | N (2) | Y (1) | Y | Y | N | |
| POU2F1 | FOXD3 | N (0) | N (0) | N | Y | N | |
| POU2F1 | GATA3 | Y (3) | N (0) | N | Y | N | |
| POU2F1 | NRC1 | N (0) | N (0) | Y | Y | N | |
| POU2F1 | POU2F1 | NAN | NAN | NAN | NAN | NAN | |
| POU2F1 | SRY | Y (4) | N (0) | N | Y | N | |
| POU2F1 | ELK1 | Y (4) | Y (2) | N | Y | N | |
| POU2F1 | EP300 | N (1) | N (0) | N | Y | N | |
| POU2F1 | ZNF42 | N (2) | N (0) | N | Y | N | |
| POU2F1 | PAX4 | N (2) | Y (1) | N | Y | N | |
| POU2F1 | KLF4 | N (1) | N (0) | N | Y | N | |
| IRF1 | TCF8 | N (2) | N (0) | N | N | N | |
| IRF1 | HNF4A | Y (3) | N (0) | N | N | N | |
| IRF1 | FOXD3 | N (1) | N (0) | N | N | N | |
| IRF1 | NF1 | Y (26) | Y (1) | N | N | N | |
| IRF1 | SRY | Y (12) | N (0) | N | N | N | |
| IRF1 | ZNF42 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| IRF1 | ILK | Y (5) | N (0) | N | N | N | |
| IRF1 | PAX4 | Y (4) | N (0) | N | N | N | |
| IRF1 | KLF4 | Y (8) | N (0) | N | N | N | |
| GATA2 | TCF8 | N (2) | N (0) | N | N | N | |
| GATA2 | HNF4A | N (1) | N (0) | N | N | N | |
| GATA2 | GATA3 | Y (158) | Y (66) | N | N | N | |
| GATA2 | SP1 | Y (81) | Y (11) | Y | N | N | |
| GATA2 | RREB1 | Y (5) | N (0) | N | N | N | |
| GATA2 | ELK1 | Y (8) | N (0) | N | N | N | |
| GATA2 | EP300 | N (1) | N (0) | Y | N | N | |
| GATA2 | ZNF42 | Y (3) | N (0) | N | N | N | |
| GATA2 | GATA1 | Y (170) | Y (12) | Y | N | N | |
| GATA2 | ILK | N (2) | N (0) | N | N | N | |
| GATA2 | ZNFN1A1 | Y (3) | N (0) | N | N | N | |
| GATA2 | PAX4 | Y (5) | N (0) | N | N | N | |
| GATA2 | KLF4 | Y (7) | N (0) | N | N | N | |
| CUTL1 | GATA3 | Y (8) | N (0) | N | N | N | |
| CUTL1 | SP1 | Y (20) | N (0) | Y | N | N | |
| CUTL1 | ZNF42 | N (1) | N (0) | N | N | N | |
| CUTL1 | GATA1 | N (1) | N (0) | N | N | N | |
| CUTL1 | ZNFN1A1 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| CUTL1 | PAX4 | Y (3) | N (0) | N | N | N | |
| CUTL1 | KLF4 | Y (4) | N (0) | N | N | N | |
| TCF1 | GATA3 | Y (26) | Y (3) | N | N | N | |
| TCF1 | JUN | Y (140) | N (0) | N | N | N | |
| TCF1 | ZNF42 | N (1) | N (0) | N | N | N | |
| TCF1 | MSX1 | Y (21) | N (0) | N | N | N | |
| TCF1 | KLF4 | Y (5) | N (0) | N | N | N | |
| TCF8 | HNF4A | N (1) | N (0) | N | N | N | |
| TCF8 | FOXD3 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| TCF8 | GATA3 | Y (4) | N (0) | N | N | N | |
| TCF8 | NRC1 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| TCF8 | POU2F1 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| TCF8 | NF1 | N (1) | N (0) | N | N | N | |
| TCF8 | ACTR1A | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| TCF8 | SRY | N (2) | N (0) | N | N | N | |
| TCF8 | ELK1 | N (1) | N (0) | N | N | N | |
| TCF8 | ZNF42 | N (2) | N (0) | N | N | N | |
| TCF8 | MYB | Y (3) | Y (2) | N | N | N | |
| TCF8 | ILK | N (1) | N (0) | N | N | N | |
| TCF8 | PAX4 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| TCF8 | KLF4 | N (2) | N (0) | N | N | N | |
| TCF8 | TCF8 | NAN | NAN | NAN | NAN | NAN | |
| TCF8 | SP1 | Y (6) | N (0) | N | N | N | |
| TCF8 | RREB1 | N (1) | N (0) | Y | N | N | |
| TCF8 | EP300 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| TCF8 | GATA1 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| TCF8 | ZNFN1A1 | N (1) | N (0) | N | N | N | |
| TCF8 | RUNX1 | Y (10) | N (0) | N | N | N | |
| TCF8 | EN1 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| PAX2 | SP1 | Y (91) | N (0) | N | N | N | |
| PAX2 | ZNF42 | N (1) | N (0) | N | N | N | |
| PAX2 | PAX4 | Y (81) | Y (2) | N | N | N | |
| HNF4A | FOXD3 | N (1) | N (0) | N | N | N | |
| HNF4A | GATA3 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| HNF4A | NRC1 | N (0) | N (0) | Y | N | N | |
| HNF4A | SP1 | Y (23) | N (0) | Y | N | N | |
| HNF4A | POU2F1 | N (2) | Y (1) | Y | N | N | |
| HNF4A | NF1 | Y (6) | N (0) | N | N | N | |
| HNF4A | ACTR1A | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| HNF4A | SRY | Y (3) | N (0) | N | N | N | |
| HNF4A | RREB1 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| HNF4A | ELK1 | Y (3) | Y (1) | N | N | N | |
| HNF4A | EP300 | N (0) | N (0) | Y | N | N | |
| HNF4A | ZNF42 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| HNF4A | GATA1 | Y (3) | N (0) | N | N | N | |
| HNF4A | ILK | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| HNF4A | ZNFN1A1 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| HNF4A | HOXA3 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| HNF4A | MSX1 | N (2) | N (0) | N | N | N | |
| HNF4A | NKX2-5 | N (0) | Y (1) | N | N | N | |
| HNF4A | PAX4 | Y (10) | N (0) | N | N | N | |
| HNF4A | KLF4 | N (1) | N (0) | N | N | N | |
| FOXD3 | NRC1 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| FOXD3 | RUNX1 | N (2) | N (0) | N | N | N | |
| FOXD3 | POU2F1 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| FOXD3 | NF1 | Y (14) | N (0) | N | N | N | |
| FOXD3 | NKX6NAN | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| FOXD3 | SRY | Y (24) | N (0) | N | N | N | |
| FOXD3 | RREB1 | N (2) | N (0) | N | N | N | |
| FOXD3 | ELK1 | Y (3) | N (0) | N | N | N | |
| FOXD3 | ZNF42 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| FOXD3 | SOX5 | Y (11) | Y (1) | N | N | N | |
| FOXD3 | ILK | N (1) | N (0) | N | N | N | |
| FOXD3 | HOXA3 | Y (3) | N (0) | N | N | N | |
| FOXD3 | EN1 | Y (6) | N (0) | N | N | N | |
| FOXD3 | PAX4 | Y (5) | N (0) | N | N | N | |
| FOXD3 | KLF4 | N (2) | N (0) | N | N | N | |
| GATA3 | NRC1 | N (0) | N (0) | N | Y | N | |
| GATA3 | SP1 | Y (161) | Y (5) | N | Y | N | |
| GATA3 | RUNX1 | Y (49) | Y (1) | N | Y | N | |
| GATA3 | POU2F1 | Y (3) | N (0) | N | Y | N | |
| GATA3 | SRY | Y (37) | Y (1) | N | Y | N | |
| GATA3 | RREB1 | Y (5) | N (0) | N | Y | N | |
| GATA3 | ELK1 | Y (15) | N (0) | N | Y | N | |
| GATA3 | EP300 | Y (3) | N (0) | N | Y | N | |
| GATA3 | ZNF42 | Y (4) | N (0) | N | Y | N | |
| GATA3 | MYB | Y (106) | Y (3) | N | Y | N | |
| GATA3 | GATA1 | Y (140) | Y (7) | N | Y | N | |
| GATA3 | ILK | Y (4) | N (0) | N | Y | N | |
| GATA3 | ZNFN1A1 | Y (4) | N (0) | N | Y | N | |
| GATA3 | HOXA3 | Y (9) | N (0) | N | Y | N | |
| GATA3 | HOXA5 | Y (12) | N (0) | N | Y | N | |
| GATA3 | MSX1 | Y (34) | Y (1) | N | Y | N | |
| GATA3 | NKX2-5 | Y (4) | N (0) | N | Y | N | |
| GATA3 | EN1 | Y (16) | N (0) | N | Y | N | |
| GATA3 | PAX4 | Y (6) | N (0) | N | Y | N | |
| GATA3 | KLF4 | Y (9) | N (0) | N | Y | N | |
| GATA3 | none | N (0) | N (0) | N | Y | N | |
| STAT2 | ZNF42 | N (1) | N (0) | N | N | N | |
| STAT2 | PAX4 | N (2) | N (0) | N | N | N | |
| STAT2 | KLF4 | N (1) | N (0) | N | N | N | |
| NFE2L1 | CREB1 | Y (3) | N (0) | N | Y | N | |
| NFE2L1 | SP1 | Y (3) | N (0) | N | Y | N | |
| NFE2L1 | MYC | Y (9) | Y (1) | N | Y | N | |
| NFE2L1 | RUNX1 | N (1) | N (0) | N | Y | N | |
| NFE2L1 | NF1 | N (0) | N (0) | N | Y | N | |
| NFE2L1 | ACTR1A | N (1) | N (0) | N | Y | N | |
| NFE2L1 | YAP1 | N (2) | N (0) | N | Y | N | |
| NFE2L1 | JUN | Y (18) | N (0) | N | Y | N | |
| NFE2L1 | SRY | Y (3) | N (0) | N | Y | N | |
| NFE2L1 | ELK1 | N (1) | N (0) | N | Y | N | |
| NFE2L1 | MSX1 | N (1) | N (0) | N | Y | N | |
| NFE2L1 | PPARA | N (0) | N (0) | N | Y | N | |
| NFE2L1 | EN1 | N (0) | N (0) | N | Y | N | |
| NFE2L1 | PAX4 | N (0) | N (0) | N | Y | N | |
| NRC1 | SP1 | N (1) | N (0) | N | Y | N | |
| NRC1 | POU2F1 | N (0) | N (0) | Y | Y | N | |
| NRC1 | NF1 | N (0) | N (0) | N | Y | N | |
| NRC1 | SRY | N (0) | N (0) | N | Y | N | |
| NRC1 | ELK1 | N (0) | N (0) | N | Y | N | |
| NRC1 | ZNF42 | N (0) | N (0) | N | Y | N | |
| NRC1 | TFCP2 | N (0) | N (0) | N | Y | N | |
| NRC1 | ILK | N (0) | N (0) | N | Y | N | |
| NRC1 | HOXA3 | N (0) | N (0) | N | Y | N | |
| NRC1 | NKX2-5 | N (0) | N (0) | N | Y | N | |
| NRC1 | PAX4 | N (0) | N (0) | N | Y | N | |
| NRC1 | KLF4 | N (0) | N (0) | N | Y | N | |
| CEBPA | ZNF42 | N (1) | N (0) | N | N | N | |
| CEBPA | HOXA3 | N (1) | N (0) | N | N | N | |
| CEBPA | PAX4 | N (2) | N (0) | N | N | N | |
| SP1 | MYCN | Y (55) | Y (2) | N | N | N | |
| CREB1 | RREB1 | N (0) | N (0) | N | Y | N | |
| CREB1 | ZNF42 | Y (3) | N (0) | N | Y | N | |
| CREB1 | PAX4 | N (2) | N (0) | N | Y | N | |
| MYC | ACTR1A | Y (5) | N (0) | N | N | N | |
| MYC | SRY | Y (432) | Y (4) | N | N | N | |
| MYC | RREB1 | Y (12) | Y (1) | N | N | N | |
| MYC | ZNF42 | Y (8) | N (0) | N | N | N | |
| MYC | ZNFN1A1 | Y (16) | Y (1) | N | N | N | |
| MYC | EN1 | Y (85) | N (0) | N | N | N | |
| MYC | PAX4 | Y (59) | Y (1) | N | N | N | |
| XBP1 | ZNF42 | Y (3) | N (0) | N | N | N | |
| XBP1 | PAX4 | Y (7) | N (0) | N | N | N | |
| XBP1 | KLF4 | Y (4) | N (0) | N | N | N | |
| POU2F1 | RUNX1 | N (2) | N (0) | N | Y | N | |
| POU2F1 | ZNFN1A1 | N (1) | N (0) | N | Y | N | |
| POU2F1 | HOXA3 | N (1) | N (0) | N | Y | N | |
| POU2F1 | none | N (0) | N (0) | N | Y | N | |
| RUNX1 | NF1 | Y (31) | Y (4) | N | N | N | |
| RUNX1 | HAND1 | Y (3) | N (0) | N | N | N | |
| RUNX1 | SRY | Y (21) | N (0) | N | N | N | |
| RUNX1 | RREB1 | N (2) | N (0) | N | N | N | |
| RUNX1 | ELK1 | Y (5) | N (0) | N | N | N | |
| RUNX1 | EP300 | Y (8) | N (0) | N | N | N | |
| RUNX1 | ARNT | Y (16) | N (0) | N | N | N | |
| RUNX1 | ZNF42 | N (2) | N (0) | N | N | N | |
| RUNX1 | MYB | Y (150) | Y (13) | N | N | N | |
| RUNX1 | TFCP2 | Y (3) | N (0) | N | N | N | |
| RUNX1 | GATA1 | Y (81) | Y (7) | N | N | N | |
| RUNX1 | ILK | Y (4) | N (0) | N | N | N | |
| RUNX1 | ZNFN1A1 | N (1) | N (0) | N | N | N | |
| RUNX1 | NKX2-5 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| RUNX1 | EN1 | N (2) | N (0) | N | N | N | |
| RUNX1 | PAX4 | Y (4) | N (0) | N | N | N | |
| RUNX1 | KLF4 | Y (5) | N (0) | N | N | N | |
| NF1 | ACTR1A | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| NF1 | SRY | Y (92) | Y (3) | N | N | N | |
| NF1 | ELK1 | Y (44) | N (0) | N | N | N | |
| NF1 | TFCP2 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| NF1 | ZNFN1A1 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| NF1 | HOXA3 | Y (10) | N (0) | N | N | N | |
| NF1 | EN1 | Y (14) | N (0) | N | N | N | |
| NF1 | PAX4 | Y (5) | N (0) | N | N | N | |
| NF1 | KLF4 | N (1) | N (0) | N | N | N | |
| ACTR1A | SRY | N (1) | N (0) | N | N | N | |
| ACTR1A | ELK1 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| ACTR1A | ZNF42 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| ACTR1A | ILK | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| ACTR1A | HOXA3 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| ACTR1A | MSX1 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| ACTR1A | PAX4 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| ACTR1A | KLF4 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| ESR1 | RREB1 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| ESR1 | ELK1 | Y (7) | N (0) | Y | N | N | |
| ESR1 | EP300 | Y (5) | N (0) | Y | N | N | |
| ESR1 | ZNF42 | N (2) | N (0) | N | N | N | |
| ESR1 | KLF4 | N (2) | N (0) | N | N | N | |
| YAP1 | SRY | Y (3) | N (0) | N | N | N | |
| YAP1 | PAX4 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| YAP1 | KLF4 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| HAND1 | SRY | Y (11) | N (0) | N | N | N | |
| HAND1 | RREB1 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| HAND1 | MYB | Y (9) | N (0) | N | N | N | |
| HAND1 | TFCP2 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| HAND1 | ZNFN1A1 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| HAND1 | PAX4 | Y (3) | N (0) | N | N | N | |
| NKX6NAN | SRY | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| NKX6NAN | SOX5 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| NKX6NAN | PAX4 | Y (4) | Y (7) | N | N | N | |
| NKX6NAN | KLF4 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| SRY | RREB1 | Y (4) | N (0) | N | N | N | |
| SRY | ELK1 | Y (13) | N (0) | N | N | N | |
| SRY | POU3F2 | N (2) | N (0) | N | N | N | |
| SRY | ZNF42 | Y (4) | N (0) | N | N | N | |
| SRY | MYB | Y (136) | Y (2) | N | N | N | |
| SRY | TFCP2 | N (2) | N (0) | N | N | N | |
| SRY | SOX5 | Y (192) | Y (19) | N | N | N | |
| SRY | ILK | Y (34) | N (0) | N | N | N | |
| SRY | ZNFN1A1 | N (2) | N (0) | N | N | N | |
| SRY | HOXA3 | Y (17) | Y (1) | N | N | N | |
| SRY | NKX2-5 | Y (3) | Y (1) | N | N | N | |
| SRY | EN1 | Y (22) | N (0) | N | N | N | |
| SRY | PAX4 | Y (15) | N (0) | N | N | N | |
| SRY | KLF4 | Y (9) | N (0) | N | N | N | |
| RREB1 | ELK1 | Y (4) | N (0) | N | N | N | |
| RREB1 | EP300 | N (1) | N (0) | N | N | N | |
| RREB1 | ARNT | Y (4) | N (0) | N | N | N | |
| RREB1 | ZNF42 | N (1) | N (0) | N | N | N | |
| RREB1 | MYB | Y (7) | N (0) | N | N | N | |
| RREB1 | TFCP2 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| RREB1 | GATA1 | Y (6) | N (0) | N | N | N | |
| RREB1 | ILK | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| RREB1 | ZNFN1A1 | N (0) | N (0) | Y | N | N | |
| RREB1 | HOXA3 | N (1) | N (0) | N | N | N | |
| RREB1 | NKX2-5 | N (1) | N (0) | N | N | N | |
| RREB1 | EN1 | N (2) | N (0) | N | N | N | |
| RREB1 | PAX4 | Y (3) | N (0) | N | N | N | |
| RREB1 | KLF4 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| ELK1 | ELK1 | NAN | NAN | NAN | NAN | NAN | |
| ELK1 | EP300 | Y (3) | N (0) | N | N | N | |
| ELK1 | ZNF42 | N (2) | N (0) | N | N | N | |
| ELK1 | GATA1 | Y (13) | N (0) | N | N | N | |
| ELK1 | ILK | Y (10) | N (0) | N | N | N | |
| ELK1 | ZNFN1A1 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| ELK1 | NKX2-5 | N (1) | Y (1) | N | N | N | |
| ELK1 | PAX4 | Y (7) | Y (2) | N | N | N | |
| ELK1 | KLF4 | N (1) | N (0) | N | N | N | |
| ELK1 | none | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| EP300 | ZNF42 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| EP300 | MYB | Y (18) | N (0) | N | N | N | |
| EP300 | GATA1 | Y (5) | N (0) | N | N | N | |
| EP300 | ILK | N (1) | N (0) | N | N | N | |
| EP300 | ZNFN1A1 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| EP300 | NKX2-5 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| EP300 | EN1 | N (1) | N (0) | N | N | N | |
| EP300 | PAX4 | N (1) | N (0) | N | N | N | |
| EP300 | KLF4 | N (1) | N (0) | N | N | N | |
| EP300 | none | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| POU3F2 | KLF4 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| ARNT | PAX4 | Y (8) | N (0) | N | N | N | |
| ZNF42 | ZNF42 | NAN | NAN | NAN | NAN | NAN | |
| ZNF42 | MYB | Y (4) | Y (1) | N | N | N | |
| ZNF42 | GATA1 | N (2) | N (0) | N | N | N | |
| ZNF42 | ILK | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| ZNF42 | ZNFN1A1 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| ZNF42 | HOXA3 | N (1) | N (0) | N | N | N | |
| ZNF42 | HOXA5 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| ZNF42 | MSX1 | N (2) | N (0) | N | N | N | |
| ZNF42 | NKX2-5 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| ZNF42 | EN1 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| ZNF42 | PAX4 | N (1) | N (0) | N | N | N | |
| ZNF42 | KLF4 | N (2) | N (0) | N | N | N | |
| ZNF42 | none | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| ZNF42 | MYCN | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| MYB | TFCP2 | N (2) | N (0) | N | N | N | |
| MYB | GATA1 | Y (169) | Y (4) | N | N | N | |
| MYB | ZNFN1A1 | Y (7) | N (0) | N | N | N | |
| MYB | EN1 | Y (20) | Y (1) | N | N | N | |
| MYB | PAX4 | Y (12) | N (0) | N | N | N | |
| TFCP2 | GATA1 | N (1) | N (0) | N | N | N | |
| TFCP2 | ZNFN1A1 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| TFCP2 | HOXA3 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| TFCP2 | PAX4 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| MYCN | PAX4 | N (1) | N (0) | N | N | N | |
| GATA1 | ILK | Y (3) | N (0) | N | Y | N | |
| GATA1 | ZNFN1A1 | Y (3) | N (0) | N | Y | N | |
| GATA1 | NKX2-5 | Y (5) | Y (1) | N | Y | N | |
| GATA1 | EN1 | Y (6) | N (0) | N | Y | N | |
| GATA1 | PAX4 | Y (6) | N (0) | N | Y | N | |
| GATA1 | KLF4 | Y (11) | Y (1) | N | Y | N | |
| SOX5 | PAX4 | N (2) | N (0) | N | N | N | |
| ILK | ZNFN1A1 | N (1) | N (0) | N | N | N | |
| ILK | NKX2-5 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| ILK | PAX4 | N (2) | N (0) | N | N | N | |
| ILK | KLF4 | Y (5) | N (0) | N | N | N | |
| ZNFN1A1 | NKX2-5 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| ZNFN1A1 | EN1 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| ZNFN1A1 | PAX4 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| ZNFN1A1 | KLF4 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| HOXA3 | NKX2-5 | N (2) | N (0) | N | N | N | |
| HOXA3 | PAX4 | Y (5) | Y (1) | N | N | N | |
| HOXA3 | KLF4 | N (2) | N (0) | N | N | N | |
| HOXA3 | none | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| HOXA5 | KLF4 | Y (4) | Y (1) | N | N | N | |
| MSX1 | EN1 | Y (63) | Y (1) | N | N | N | |
| MSX1 | PAX4 | Y (18) | N (0) | N | N | N | |
| MSX1 | KLF4 | Y (4) | N (0) | N | N | N | |
| NKX2-5 | PAX4 | N (1) | N (0) | N | N | N | |
| NKX2-5 | KLF4 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| NKX2-5 | none | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| NKX2-5 | EN1 | N (2) | Y (1) | N | N | N | |
| EN1 | PAX4 | Y (9) | N (0) | N | N | N | |
| PAX4 | PAX4 | NAN | NAN | NAN | NAN | NAN | |
| PAX4 | KLF4 | Y (4) | N (0) | N | N | N | |
| PAX4 | none | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| KLF4 | none | N (0) | N (0) | N | Y | N | |
| PAX5 | HNF4A | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| PAX5 | GATA3 | Y (54) | Y (4) | N | N | N | |
| PAX5 | ILK | N (2) | N (0) | N | N | N | |
| FOXJ2 | TBP | Y (4) | N (0) | N | N | N | |
| FOXJ2 | ZNF42 | N (2) | N (0) | N | N | N | |
| CEBPB | YY1 | Y (22) | N (0) | N | N | N | |
| CCDC6 | NFATC2 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| TFAP2C | ARNT | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| CUTL1 | NFYB | N (1) | N (0) | N | N | N | |
| NFYC | TCF8 | N (1) | N (0) | N | N | N | |
| NFYC | NF1 | Y (7) | N (0) | N | N | N | |
| NFYC | MYB | Y (4) | N (0) | N | N | N | |
| LMO2 | HOXA5 | Y (10) | N (0) | N | Y | N | |
| PAX6 | IRF1 | Y (9) | N (0) | N | Y | N | |
| NFYB | CEBPA | N (1) | N (0) | N | N | N | |
| USF1 | MYCN | Y (4) | N (0) | N | N | N | |
| HNF4A | NRC1 | N (0) | N (0) | Y | N | N | |
| MYB | MYB | NAN | NAN | NAN | NAN | NAN | |
| SOX9 | IRF1 | Y (5) | N (0) | N | N | N | |
| POU2F1 | ACTR1A | N (0) | N (0) | N | Y | N | |
| CUTL1 | RREB1 | N (1) | N (0) | N | N | N | |
| CUTL1 | EP300 | N (1) | N (0) | N | N | N | |
| CUTL1 | MYB | Y (11) | N (0) | Y | N | N | |
| TCF8 | HAND1 | N (1) | N (0) | N | N | N | |
| SRF | KLF4 | Y (16) | N (0) | N | N | N | |
| GATA3 | ACTR1A | N (1) | N (0) | N | Y | N | |
| NRC1 | ACTR1A | N (0) | N (0) | N | Y | N | |
| POU2F1 | ILK | N (1) | N (0) | N | Y | N | |
| NF1 | MYB | Y (231) | Y (6) | N | N | N | |
| ACTR1A | EP300 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| ACTR1A | GATA1 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| TGIF | KLF4 | Y (5) | N (0) | N | N | N | |
| ELK1 | HOXA5 | N (2) | N (0) | N | N | N | |
| ARNT | KLF4 | Y (6) | N (0) | N | N | N | |
| MYB | SOX5 | Y (13) | N (0) | N | N | N | |
| ZNFN1A1 | HOXA5 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| HOXA5 | PAX4 | Y (3) | Y (1) | N | N | N | |
| PAX5 | NFATC2 | Y (9) | N (0) | N | N | N | |
| FOXJ2 | ARNT | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| TAL1 | KLF4 | Y (6) | Y (1) | N | N | N | |
| ZNF482 | GATA3 | N (0) | N (0) | N | N | N | |
| YY1 | YY1 | NAN | NAN | NAN | NAN | NAN | |
| GoogleScholar: Number of hits in scholar.google.com; Y if the number of hits is > 2 | |||||||
| PubMed: Number of hits in PubMed; Y if the number of hits is > 5 | |||||||
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| MPPI: Pagel, P. et al. Bioinformatics 21:832-4 (2005). http://mips.gsf.de/proj/ppi/ | |||||||